Sekitar tahun 1956 – 1971 berdirilah sekolah
dasar di wilayah Bondongan – Bogor yaitu SD Santa Maria Fatima yang dikelola
oleh suster – suster RGS (
Gembala Baik ). Seiring dengan berjalannya waktu , situasi lingkungan sekitar
Bondongan makin ramai , bahkan sangat gaduh dengan suara kendaraan. Situasi ini
inilah yang membuat suster – suster ( Sr.Rosari , diantaranya ) tidak merasa
nyaman lagi untuk melaksanakan karyanya.Maka sekitar tahun 1971 pengelolaannya
beralih kepada suster – suster Fransiskan Sukabumi (SFS). Berturut – turut
Sr.M. Ancilla ,SFS ;suster Theresia adalah pemimpin yayasan perwakilan
Bondongan saat itu. Bertepatan itu pula tahun 1983 SD Santa Maria Fatima
berganti nama menjadi SD Mardi Yuana. Berdasarkan permohonan dari Ketua
Yayasan Mardi Yuana Jl.R.E. Martadinata Sukabumi tertanggal 21 Desember
1983,maka terhitung mulai tanggal 1
Oktober 1984 oleh Kepala Dinas P dan K Prof.DT I Jawa Barat ;SD Mardi Yuana tercatat sebagai SD Swasta
pada dinas P dan K DT. I Jawa Barat dengan nomor urut 15.Berdasarkan
permohonan ijin pendirian Sekolah Dasar Mardi Yuana 2 dari Ketua Yayasan Mardi
Yuana tertanggal 17 November 1992 kepada kantor wilayah Depdikbud Provinsi Jawa
Barat , maka ; terhitung tanggal 20
April 1993 izin pendiriannya dikabulkan.Sejak tanggal 1 Juli 2002 ketua Yayasan Mardi Waluya Jl. Veteran II No.
10 Sukabumi mendapat persetujuan pengelolaan penyelenggaraan pendidikan dan
administrasinya beralih dari Yayasan Mardi Yuana ke Mardi Waluya. Setelah menjadi SD Mardi Waluya ,
tantangan demi tantangan dihadapi bersama pimpinan Perwakilan yayasan yaitu
Sr.M. Zita,SFS ,Sr.M. Vincentia,SFS , hingga sekarang Sr.M.Emmanuella,SFS
adapun kepala sekolah yang pernah memimpinnya yaitu : 1.Ibu Maryati Partawinata ( 1971 – 1988 ) 2.Bapak Lily Suryadi (alm ) ( 1988 –
1996 ) 3.Bapak C.D. Tasirun,A.Ma. Pd ( 1996 –
1997 ) 4.Bapak Agustinus Mujiya ,S.Pd ( 1997 –
2001 ) 5.Bapak Ign . Budi Prabawa,S.Pd.SD (
2001 – 2007 ) 6.Bapak Hilarius Anton Rubana ,S.Pd.SD (
2007 – 2012 ) 7.Ibu
Sisilia Sumiati,S.Pd ( 2012 – 2015 ) 8.Albertus
Winarto, S. PD ( 2015 – 2017 ) 9.Albertus
Agus Suyanto, M.Pd ( 2017 – sekarang ) Demikian
sejarah singkat keberadaan SD Mardi Waluya Bondongan Bogor .Semoga sekolah kami
makin bersinar dan eksis sehingga tetap menjadi sekolah favorit di masyarakat.